1. Cultura Panzaleo o Cosanga

Esta fase cultural indígena se ubicó entre los años 400 a.C. y 948 d.C.

Ocupó las regiones comprendidas entre los ríos Quijos y Cosanga, al oeste de la provincia de Napo, especialmente junto a los actuales sitios de Papallacta, Cuyuja, Baeza, Cosanga, Borja, El Chaco, Huila y Chalpi.

Vivían en poblados de hasta quince o veinte casas alrededor de una plaza, y llevaron una vida religiosa y ceremonial muy intensa. En cuanto a sus costumbres funerarias,«parece que al muerto lo colocaban en posición extendida dentro de una caja o sarcófago formado por varias piedras lajas; junto al difunto se colocaban algunas hachas de piedra desde una hasta 20 ó 30. Dada la relativa escasez de tumbas sospechamos la práctica del canibalismo»

2. Cultura Napo

Fue una cultura ubicada en las actuales provincias de Sucumbíos, Orellana, Napo y Pastaza, en la Amazonia ecuatoriana. Por el norte el río Aguarico, por el Este territorio peruano y por el Oeste los valles de Misahuallí y de Jondachí. Su origen está relacionado con los Omagua, de la familia lingüística tupi-guaraní, proveniente del Amazonas medio.

Los sitios Napo están ubicados en los márgenes altos del río Napo y están localizados en las cimas de las colinas próximas al río. El hallazgo de metates y manos de moler evidencia el uso de granos en su alimentación, probablemente de maíz.

3. Cultura Huaoranis

También llamados como Aucas término que significa Salvaje, aguerrido y fue dado por los misioneros y conquistadores españoles por la agresividad de este grupo frente a la presencia foránea; esta denominación lleva muchas equivocaciones debido a que se usa como sinónimo de rebelde a todo pueblo que no se dejaba conquistar.

Los Huaoranis han sido desde siempre un pueblo inter-fluvial de cazadores y recolectores seminónadas o con nomadismo cíclico. La huerta se encuentra alrededor de la vivienda, las plantaciones de yuca y plátano juegan papel fundamental en su dieta, también cultivan chinta, camote, maíz. A diferencia de otras etnias solo utilizan el sistema de roza, pero no el de quema de árboles, un a vez que son derribados se los deja que se pudran en el suelo. Tradicionalmente la nacionalidad Huaorani era nómada; en la actualidad aún persisten las migraciones poblacionales temporales y otras comunidades están sedentarizadas.

Las casas Huao ahora son construidas con palmas entretejidas, el techo  a diferencia de las casas de otros pueblos amazónicos casi llega hasta el suelo, tiene dos puertas, llama la atención la limpieza y amplitud interior, cada 6 o 7 años se deteriora y se empieza la construcción de otra y queman la antigua. En el interior de la casa se observan hamacas, es el elemento que usan para pernoctar, al pie de la hamaca se observa un fogón encendido para ahuyentar a los animales.  

4. Cultura de los Cofanes

Se encuentran asentados en la Provincia de Sucumbíos, en la parte superior del río Aguarico, río Sinagüé y en la frontera con Colombia. 

Antiguamente tenían semejanza con la vivienda tradicional del pueblo shuar. Las paredes las construían con madera y el techo con hojas de palma y ahora es una casa unifamiliar, con materiales no tradicionales.

Las mujeres sionas, secoyas y cofanes transforman las semillas multicolores que encuentran en el bosque en vistosos collares y pulseras que se unen con hilos de chambira, una planta del bosque. Para añadirle más color a sus creaciones usan alas de escarabajos verdes fosforescentes y pequeñas piedras encontradas en los ríos. Las ofertas de artesanías incluyen las lanzas y cuchillos negros hechos con chonta

5. Cultura Secoya

Se encuentran ubicados en la Amazonia del Perú y del Ecuador. En el Ecuador están en la provincia de Sucumbíos, cantón Shushufindi, parroquia San Roque y en el cantón Cuyabeno, parroquia Tarapoa, en las riberas del río Aguarico.

Construcción en forma elíptica, habitada por una familia extensa, hechas de caoba o cedro con techo de palma  y pilares de madera para contrarrestar el peligro de los animales roedores.

Los Secoya obtienen su sustento principalmente de la agricultura itinerante y de la extracción de madera; la ganadería se da en menor medida. Aún subsisten en pequeña escala sus actividades económicas tradicionales como caza, pesca y recolección de frutos. Los principales productos que siembran son yuca, café, plátano, maíz, maní, frutas, arroz, fréjol y ají.